Der Verein verfolgt ausschliesslich gemeinnützige, pädagogische und wissenschaftliche Zwecke. Er bezweckt die Verbesserung und Erhaltung des Niveaus der Kinderchirurgie in der ganzen Welt zum Wohle der Allgemeinheit, ohne dabei Gewinn anzustreben. Dieses Ziel soll insbesondere erreicht werden durch: die Förderung und Integration der Kinderchirurgie in der ganzen Welt; den Betrieb eines Zentrums für Zusammenarbeit und Informationsaustausch zwischen den vom Verband anerkannten kinderchirurgischen Verbänden, Gesellschaften und Organisationen; die Förderung der Entwicklung und Aufrechterhaltung eines hohen Standards in den Bereichen Pflege, Ausbildung, Training und Forschung in der Kinderchirurgie und verwandten Wissenschaften in der ganzen Welt; die Förderung von klinischen und wissenschaftlichen Kongressen von Verbänden, Gesellschaften und Organisationen der Kinderchirurgie, die vom Verband anerkannt sind. Der WOFAPS ist politisch neutral und wird sich nicht an politischen Kampagnen beteiligen, es sei denn, diese haben einen Einfluss auf den Zweck des Verbands.