Der Verein führt eine Privatschule, die alle gesetzlichen Anforderungen der Primar- und Sekundarschule des Kantons Zürich erfüllt. Die Freie Schule Winterthur ist ein lebendiger Lernort, in dem sich die Schülerinnen und Schüler entwickeln können und in Ihrer Persönlichkeit gestärkt werden. Sie werden in ihrer individuellen Entwicklung unterstützt und ihre Stärken gefördert. Die pädagogische Ausrichtung basiert auf einem wohlwollenden und wertschätzenden Miteinander, In dem die Jugendlichen lernen und ihr Wissen erweitern können. Die Jugendlichen haben vielfältige Möglichkeiten am schulischen Leben zu partizipieren. Der Verein dient dem Allgemeininteresse der Schulbildung, ist politisch und konfessionell neutral sowie nicht gewinnorientiert und uneigennützig.