Die AUC von Rifabutin war in einer Studie mit HIV-Patienten unter der Kombination um ca. 77% erhöht. In einer anderen Studie wurden sogar Erhöhungen der mittleren Rifabutin-Konzentration von 400% unter Konbination mit Clarithromycin festgestellt. Das Risiko für das Auftreten von Neutropenien scheint in der Kombination erhöht. Ausserdem kam es zu einer Verringerung der AUC von Clarithromycin um etwa 50%. Unter subtherapeutischen Spiegeln kann es zu einer verminderten Wirksamkeit von Clarithromycin kommen. Es traten gehäuft Fälle von Uveitis auf.