Der Zweck des Vereins Mare Incognita ist: Förderung des sportlichen Segelns auf hoher See, Aus- und Weiterbildung von bereits lizenzierten Schiffsführern und Crewmitgliedern, Organisation und Durchführung von Langstreckenfahrten auf hoher See, Teilnahme an Hochseeregatten, Förderung meereskundlicher Forschung. Der Verein hält und betreibt mindestens eine unter schweizerischer Flagge fahrende Segelyacht. Der Verein ist rein gemeinnütziger Art und verfolgt keine wirtschaftlichen Interessen.