In einer Studie führte die Kombination von Efavirenz mit Atovaquon/Proguanil bei 20 HIV-Infizierten verglichen mit 18 gesunden Probanden, die nur Atovaquon/Proguanil erhielten, zu einer Erniedrigung der Atovaquon-AUC auf im Mittel 25%. Die AUC von Proguanil sank im Mittel auf 57% ab. Eine Wirkungsabschwächung der Malariaprophylaxe kann nicht ausgeschlossen werden.